Cell | 免疫传染病中免疫细胞特异基因调控动态全景图

东京大学的分析执法人员和RIKEN Research分析所的助手们早就创设了首个针对自身性疾病癌症和自身炎症性癌症的表型物质样本库。决心这一自然资源能为抗体癌症的演进提供新的见解，并可能会有助于药物的发现。科学家们还决心，与抗体就其的表型物质组样本图解再一可能会应用于诸如COVID-19等传染病的分析。

东京大学概念设计分析助理，临床风湿病学家，动态表型物质组学研究员Mineto Ota教授话说：“要明了癌症，就必须深刻解释表型物质突变的动态。有了这个样本集，我们就可以将与癌症就其的DNA表型物质变化的样本与对癌症复发机制比较关键性的表型物质和肝细胞一般来话说联系痛快。”Ota是该团队公开发表在《Cell》杂志上的公开发表文章的主要创作者，公开发表文章结尾为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该概念设计是与Chugai Pharmaceutical的科学家们协作同步进行的。

创作者确信，抗血液皮细胞的癌症（IMD）包括从自身性疾病到自身炎症的多种生理。他们引述，尽管IMD之后炎性肝细胞因子的异常活动表明抗体肝细胞动态起因了变化，但是，“对于IMD的就其表型物质甚至就其肝细胞一般来话说大相径庭。”

全表型物质组共同点分析（GWAS）发现了许多与IMD就其的表型物质组亚基。但是，在此类共同点分析之后鉴定造出的许多表型物质突变都坐落调节表型物质“on”或“off”表示的DNA非编码器区外，而不是坐落表型物质编码器表型物质之后。分析工作小组引述：“GWAS早就说明了了许多与简单个体和癌症就其的表型物质组亚基，包括IMD。这些突变之后的大多数都坐落非编码器表型物质组区外，尤其是诱导电路，如增强子和启动子。”

为了说明了诱导DNA的动态，一种相异一般来话说的表型物质组分析，被称作表示定量个体表型物质亚基（eQTL），有助于将DNA表型物质的差异性与表型物质表示的差异性联系痛快。利用eQTL样本，分析执法人员可以对诱导DNA表型物质的借以、诱导表型物质之后的突变如何冲击其诱导表型物质的表示以及这些表型物质表示差异性如何导致癌症做造出不够明智的猜测。

其它针对抗体的eQTL分析早就在同步进行之后，但先前的分析工作只包括肥胖症数以千计，并检查了极少使用量的肝细胞一般来话说。分析执法人员确信：“对肥胖症供体抗体肝细胞的分析可能会无法猎取癌症正常下发现的一系列eQTL振荡。此外，虽然对抗体肝细胞的最初刺激可以在某种程度上模拟癌症正常，但并不心里解读造出血液的内分泌自然环境。”

Ota补足道：“炎症正常下，抗体肝细胞的物理功能性与肥胖症正常下的相同肝细胞各不相同。与抗体现况就其的表型物质突变可能会只在患病正常下起作用，因此对于这种一般来话说的表型物质分析，从真实病患身上获取检验比较关键性。”

在他们简介路透社的分析之后，分析工作小组对79名肥胖症数以千计和337名被检验患有10种相异一般来话说抗血液皮细胞癌症（包括类风湿性关节炎、全面性红斑狼疮和全面性硬化症）的病患同步进行了全表型物质组高通量。所有数以千计都是日本土生土长。

明了抗血液皮细胞的癌症带有挑战性，因为尽管每种癌症在临床上都是相异的，但仍有许多重叠之处，并且带有相同检验的病患可能会会表现造出比较相异的病症。分析执法人员补足话说：“由于所有这些多元性，一次学习一种抗血液皮细胞癌症的能力是极少的。但是，如果我们一起分析10种癌症，就可以不够全盘地明了这些一般来话说的癌症。”

在已完成全表型物质组高通量后，分析执法人员从数以千计的血液检验之后分离造出来28种相异一般来话说的抗体就其肝细胞，并观测了这些肝细胞之后的表型物质表示。“我们在图解之后看得见，每种抗体肝细胞一般来话说都有相异的eQTL结果，这可以并不知道我们肝细胞一般来话说彼此之间表型物质诱导的差异性，以及哪种肝细胞一般来话说对于演进哪种癌症至关关键性。”分析执法人员话说。

创作者通报话说，“在表型物质表示分析之后，我们在一个平台上对多个IMD同步进行比较，使我们都能描述每个癌症（病患）的特征，并辨别与单个癌症特异性就其的表型物质，以及在三组IMD之后痉挛的通路……我们的样本集使我们都能检测每个特定肝细胞一般来话说之后eQTL振荡的内分泌（癌症）背景驱动的干扰。”

分析执法人员将想得到的自然资源命名为东京大学抗体肝细胞表型物质表示图解（ImmuNexUT），并话说它都有了使用东南亚土生土长数以千计创设的最大的eQTL样本集。他们归纳道：“我们确定了抗体肝细胞一般来话说特异性的eQTL振荡，包括之前未路透社的相似肝细胞一般来话说，它们在内分泌炎症前提条件下的多元性，以及这些eQTL与IMD表型彼此之间的显著共同点。”

“到此前，在这一领域，大规模的表型物质组和动态表型物质组分析主要是利用拉丁美洲**同步进行的，尽管社会阶层多元性对于简单解释表型物质组动态至关关键性。”分析执法人员话说，“这个日本受试者的eQTL图解对于克服这种以拉丁美洲为之后心的偏见，结合拉丁美洲的样本集进一步分析DNA突变的动态，也带有关键性意涵。”

分析执法人员决心ImmuNexUT样本库将继续上升，并再一为病患导致不够好的结果。他们话说：“与之后路透社的自然资源相比，我们的样本集带有各不相同而薄弱的特点，包括全盘的抗体肝细胞可分、**彼此之间抗体现况的变化以及同质的非拉丁美洲**。”