顺应潮流:仅有血浆ctDNA-MRD检测的应用前景!

2022-02-28 00:40:00 来源:
分享:

"酪氨酸被确立MRD检验的潜力是指明的,渴望这些成效将继续大大提颇高新一代MRD检验的稳定性。"

肝癌的MRD检验是一种灵巧且特异的能用检测肝癌病患血液循环中的源性单链(如ctDNA)相对数量的作法。在这种状态下,病患没有人肉眼可见的肿瘤,但确实共存标准化内外科影像作法不会检验到但最后都会导致肝癌发作的也就是说肿瘤。

MRD,常常叫作也就是说存留肿瘤(Minimal Residual Disease)。适用“Minimal” (也就是说)这个名词,是因为它在文献资料和内外科专家中的更常常用。不过,“Minimal”这个名词可能有着“误导性”,因为低颇高水平的病变在临床表现和疗程决策各个方面也可能有着最主要意义。“Measurable”(可测量)一名词可更直观地描述存留在医护人员母体的肝细胞的共存。NCCN最新同时适用了“Minimal Residual Disease”(也就是说存留肿瘤)和“Measurable Residual Disease”(可测量存留肿瘤)两个术语。

此内外,可行性研究成果表明在原子颇高水平上检验多种肝癌型式的ctDNA某种程度有着内外科持续性,文献资料和内外科专家有时也都会适用“Molecular Residual Disease”(原子存留肿瘤)一名词。

近年来,境内内外在也就是说中的基于ctDNA的MRD审核(ctDNA-MRD)的内外科数据集和证词日益多,开启了也就是说瘤MRD检验的潮流。也就是说瘤ctDNA-MRD检验的从新技术流派主要有两大类:

1)Tumor-informed assays(不对量化)

对原发秘密三组织顺利完成核酸以认定病患的特异序列变异著者,然后所设计核酸内置panel或适用相同panel顺利完成个性化的ctDNA检验量化。

2)Tumor-uninformed assays(不不对量化)

也可以叫作Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即无均需原发秘密三组织,仅仅比如说一三组而无须改到核酸/探针所设计的与肝癌型式相关的相同panel顺利完成ctDNA检验量化,常常在检验ctDNA基因三组突变的同时,借助于ctDNA酪氨酸或图片三组学等多三组学作法。回避到了秘密三组织样本太少或检测位点太少或TAT耽误等难题。

Tumor-informed assays的从新技术意图更适用大众的观念,在保障颇高抗体的此前提下,可通过检测多位点的sample-level(样本颇高水平)大大降低其准确度,从新技术门槛来得大不是之内外颇高。Tumor-uninformed assays的从新技术意图更十分相似晚筛,通过大大提颇高site-level(位点颇高水平)检验准确度并借助于ctDNA酪氨酸或图片三组学并相辅相成建模线性大大降低其准确度和抗体,从新技术门槛来得大很低。

2021年4同月29日,《Clinical Cancer Research》网络公开发表了“仅仅适用血清ctDNA检验结肝癌病患也就是说存留肿瘤(MRD)”的社论,首次公开了Guardant Reveal的研究成果数据集:MRD检验准确度近到91%,抗体近100%,这些见到支持者了仅仅血清ctDNA-MRD检验(Tumor-uninformed assays)的潜在内外科应用。

2021年8同月13日,《Clinical Cancer Research》网络公开发表了“顺应潮流:仅仅血清ctDNA-MRD检验的应用此前景”的社论,在这里研究成果者们讨论审核了仅仅血清ctDNA检验MRD的战斗能力,以及将酪氨酸拆分到ctDNA检验的潜在好处。2

Parikh及其上司1 和Taieb及其上司3 讨论了仅仅血清ctDNA-MRD检验在结肝癌(CRC)病患中的的潜在内外科应用。

▲ ctDNA酪氨酸和基因三组突变在两项研究成果中的的应用来得(Parikh和Taieb)

结肝癌(CRC)的疗程几乎接踵而来着一个挑战,即相当多的CRC病患因以此前疾病发作而过晚丧生。尽管内外科适用了标准化的专门设计疗程,但颇高几率IIIC期CRC病患的5年生存不下也仅仅有53%,话虽如此是没有人见到MRI上未有检验到的也就是说存留肿瘤(MRD)。4

目此前,仍迫切无均需直观相符哪些病患术后共存MRD,以帮助教导增加或增加专门设计疗程,并增加皮肤病的有可能,同时最大限度地增加能避免疗程的相关毒性。

在以此前的几年里,我们对ctDNA在CRC诊断和临床表现中的的应用有了广泛应用的了解到。目此前,基于ctDNA的MRD审核恰巧广泛应用应能用肝癌的疗程中的。

ctDNA是由DNA的短图片三组成(大约130-150bp),由肝细胞通过细胞分裂、坏死或分泌释放到泌尿系统中的。 ctDNA的寿命较短致使其成为极端的实时负荷研究课题,它的共存可能再现了MRI上看不到的扰转移。

在皮肤病性疗程结束后,ctDNA中的单单现的体细胞基因三组突变对随后的MRI发作有着很低的阳性预见效用,之内外是当这些基因三组突变与切除的秘密三组织中的的基因三组突变相匹配时。检验这种ctDNA表述的MRD可以在I-III期CRC中的提此前MRI数同月预见发作,从而为一三组最后都会发作的CRC病患备有一个审核从新疗法的售票厅。然而,这些ctDNA政治体制基因三组突变表述的MRD检验作法的准确度几乎是有限的,迫切无均需改进型其检验稳定性。

ctDNA的酪氨酸检验很低ctDNA的政治体制基因三组突变检验。ctDNA的酪氨酸精神状态常在CRC中的非常常常常见,并被视为大多数癌变的以此前阶段。这种酪氨酸,具体表述为DNA中的胞嘧啶的C5右边添加氨基烷基,调节郊内外基因三组的表近,有数经典的惧癌变三组失活。与政治体制基因三组突变远比,CRC中的共存更多的酪氨酸精神状态常区域,为大大提颇高MRD检验的准确度备有了机都会。SEPT9,就是第一个透过血液循环检验单基因三组酪氨酸精神状态常顺利完成乳癌和以此前检验CRC的作法。尽管ctDNA酪氨酸有这些不同之处,但这些相同的特点也无均需审慎,以保持检验量化的抗体,并尽量增加真阳性的有可能。

在这种剧中下,Parikh和Taieb的正因如此最从新研究成果结果为我们对ctDNA稳定性的明白备有了有用的补充,即无均需原发秘密三组织,仅仅通过血液循环ctDNA酪氨酸或建立联系ctDNA基因三组突变均可顺利完成直观的MRD审核。与其他无均需对原发秘密三组织顺利完成核酸以教导后续ctDNA量化的检验相异,正因如此研究成果探讨了Tumor-uninformed assays的持续性,它有几个竞争者,有数较快的TAT,降低初始成本,对秘密三组织太少或不能用的病患顺利完成检测。

Parikh等人备有了一种ctDNA酪氨酸相辅相成ctDNA政治体制基因三组突变的相同panel顺利完成MRD的量化审核(NGS作法),与其他商业上能用的MRD检验作法远比,这种作法不无均需切除的秘密三组织以及内置化。在最后疗程后适用时,这种仅仅血清ctDNA-MRD检验对发作有着内外科意义的抗体(100%)和准确度(55.6%),通过拆分密切相关序列特点和纵向检测量化,其准确度可大大降低至91%。1 该作法被能用恰巧在顺利完成的革从新研究成果,有数教导IIA期结肠癌疗程决策的NRG协作三组研究成果(NCT04068103)。虽然还无均需额内外的数据集集来验证这些见到,但这些结果说明了基于ctDNA的MRD检验在不不对的情况下可遵从的检验稳定性特点。

Taieb等人的研究成果透过了一对先此前被证明是CRC切除后临床表现相关的酪氨酸基因三组上标物WIF1和NPY(ddPCR作法),并将它们应能用PRODIGE-GERCOR IDEA-France试验,将III期CRC病患随机分为3个同月 vs 6个同月的专门设计化疗。在对出席III期试验的III期CRC病患顺利完成的首次ctDNA-MRD审核中的,有13.8%的病患术后为ctDNA-MRD阳性,并被获知为独立的临床表现研究课题。3 同时,研究成果者也指单单,与其他适用NGS作法的ctDNA-MRD研究成果远比,本研究成果中的ctDNA的阳性不下较少。准确度和PPV某种程度低于NGS检验结果,ctDNA-MRD阳性和阴性的5年DFS分别为65%和73%,尽管专门设计疗程的和不难得的此前量化样本管控但都会对这些结果归因于影响。该作法除此以外的是其相对简单,非常常低的成本和潜在的描绘出性,不无均需商业检验中的所见的专利检验作法。恰巧在顺利完成的革从新研究成果将进一步审核仅仅血清ctDNA检验是否是必均需直观审核MRD,以便对CRC病患顺利完成几率分层,并教导专门设计疗程决策。

无论适用何种作法,仅仅用血清ctDNA-MRD检验来教导CRC病患的疗程暂时,无均需可靠且直观的检验作法。均需大大降低仅仅血清ctDNA-MRD检验的准确度来相符哪些病患可以从疗程业余队中的获益,以尽量避免不恰当地回避颇高危病患遵从较少其中心的疗程。Parikh及其上司的研究成果试验中,拆分序列和密切相关序列以及纵向血清检测,可很大大大提颇高仅仅血清ctDNA-MRD的准确度。远比之下,ctDNA-MRD检验的颇高抗体对于ctDNA作为一个清晰的生物学研究课题来相符疗程替换是至关最主要的。由于抗体太少,真阳性的ctDNA-MRD但都会使病患遵从能避免的强化疗程。Parikh及其上司的研究成果结果证明,除政治体制基因三组突变内外,还可以通过相辅相成密切相关序列酪氨酸特点的量化来保持抗体。Taieb等人的量化作法的竞争者在于大大提颇高了内外科特点的准确度和临床表现,但是,恰巧如研究成果者默许的那样,单独的两个基因三组酪氨酸上标可能不会备有与相辅相成政治体制基因三组突变作法的稳定性特点。最主要的是,这项工作也强调了标准化化量化此前必须的最主要性,因为各种提炼单单作法可以在很大程度上影响ctDNA的得不下和清晰性。在未有来的研究成果中的,这些量化此前的回避将来得日益最主要。

酪氨酸被确立MRD检验的潜力是指明的,渴望这些成效将继续大大提颇高新一代MRD检验的稳定性。总之,仅仅血清ctDNA-MRD的检验备有了一个独特的机都会,适用一种无创作法来聚焦疗程计划,并也许根除颇高危病患的扰乳腺癌肿瘤。这些研究成果结果无疑为未有来ctDNA-MRD教导的革从新内外科试验铺平了路段。

MRD,几乎是一个较快拓展的领域,我们预料近两年但都会单单现从新的证词,要么显示单单MRD检验的内外科持续性的显然,要么显示单单MRD检验的其他竞争者和从新用途。

参考资料:

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.

分享: