Cell | 免疫疾病之中免疫细胞特异基因调控动态全景图

2021-12-20 02:21:06 来源:
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京都大学的科学研究医护人员和RIKEN Research科学研究所的合作者们不太或许建起了首个针对自身免疫细胞性病症和自身黏膜性病症的性状采样库。渴望这一天然资源能为免疫细胞病症的发展提供新的见解,并或许有利于口服的找到。研究小组们还渴望,与免疫细胞持续性的遗传物质采样图说道最后或许应用诸如COVID-19等传染病的科学研究。

京都大学单项科学研究兼职,医学风湿病学家,系统遗传物质学领域专家Mineto Ota博士说道:“要了解病症,就需要深刻理解性状表征的系统。有了这个采样集,我们就可以将与病症持续性的DNA多肽巨大变化的采样与对病症发病机制相当最主要的性状和肝细胞各种类型联系起来。”Ota是该团队发表在《Cell》新闻周刊上的文章的主要原作者,文章标题为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该单项是与Chugai Pharmaceutical的研究小组们合作透过的。

原作者写到,免疫细胞依赖性的病症(IMD)都有从自身免疫细胞性到自身黏膜的多种病理。他们表明,尽管IMD中会炎性肝细胞因子的出现异常活动表明免疫细胞肝细胞系统发生了巨大变化,但是,“对于IMD的持续性性状甚至持续性肝细胞各种类型大不相同。”

正因如此遗传物质关联科学研究(GWAS)找到了许多与IMD持续性的遗传物质核糖体。但是,在此类关联科学研究中会鉴定成的许多性状表征都座落在调节性状“on”或“off”表达出来的DNA非编码区域,而不是座落在性状编码多肽中会。科学研究小组表明:“GWAS不太或许说道明了了许多与复杂表型和病症持续性的遗传物质核糖体,都有IMD。这些表征中会的大多数都座落在非编码遗传物质区域,尤其是调节积体电路,如增强子和核糖体。”

为了说道明了调节DNA的系统,一种不尽相同各种类型的遗传物质分析,称为表达出来量化表型性状核糖体(eQTL),有利于将DNA多肽的歧异与调控的歧异联系起来。依靠eQTL采样,科学研究医护人员可以对调节DNA多肽的目的、调节多肽中会的表征如何影响其调节性状的表达出来以及这些调控歧异如何导致病症做成更为理应的猜测。

其它针对免疫细胞的eQTL科学研究不太或许在透过中会,但先前的科学研究工作只都有心理健康自愿者,并探测了依赖于数量的肝细胞各种类型。科学研究医护人员写到:“对心理健康供体免疫细胞肝细胞的科学研究或许无法捕获病病症态下找到的一系列eQTL不稳定性。此外,虽然对免疫细胞肝细胞的各种类型刺激可以在某种程度上模拟病病症态,但并不总是反映成体内的心理自然环境。”

Ota补足道:“炎病症态下,免疫细胞肝细胞的物理特性与心理健康状况下的相同肝细胞截然不尽相同。与免疫细胞状况持续性的性状表征或许只在患病状况下起作用,因此对于这种各种类型的性状科学研究,从单纯症状手上获取采样相当最主要。”

在他们最新报道的科学研究中会,科学研究小组对79名心理健康自愿者和337名被诊断忧郁症10种不尽相同各种类型免疫细胞依赖性病症(都有类风湿性关节炎、持续性化脓性和持续性硬化症)的症状透过了正因如此遗传物质测序。所有自愿者都是南韩土生土长。

了解免疫细胞依赖性的病症不具原创性,因为尽管每种病症在医学上都是不尽相同的,但仍有许多交叠之处,并且不具相同诊断的症状或许会发挥成相当不尽相同的病症。科学研究医护人员补足说道:“由于所有这些重要性,一次研修一种免疫细胞依赖性病症的能力是依赖于的。但是,如果我们一起科学研究10种病症,就可以更为正因如此面地了解这些各种类型的病症。”

在完成正因如此遗传物质测序后,科学研究医护人员从自愿者的体液采样中会分离成28种不尽相同各种类型的免疫细胞持续性肝细胞,并测量了这些肝细胞中会的调控。“我们在图说道中会看到,每种免疫细胞肝细胞各种类型都有不尽相同的eQTL结果,这可以告知我们肝细胞各种类型间性状调节的歧异,以及哪种肝细胞各种类型对于发展哪种病症至关最主要。”科学研究医护人员说道。

原作者研究报告说道,“在调控分析中会,我们在一个和平台上对多个IMD透过比较,使我们能够描述每个病症(症状)的特点,并识别与单个病症免疫持续性的性状,以及在一组IMD中会心理因素的通路……我们的采样集使我们能够探测每个特定肝细胞各种类型中会eQTL不稳定性的心理(病症)背景涡轮机的干扰。”

科学研究医护人员将给与的天然资源命名为京都大学免疫细胞肝细胞调控图说道(ImmuNexUT),并说道它值得一提的是了使用东南亚土生土长自愿者建起的仅次于的eQTL采样集。他们阐述道:“我们确定了免疫细胞肝细胞各种类型免疫的eQTL不稳定性,都有那时候未报道的罕见肝细胞各种类型,它们在心理黏膜需要下的重要性,以及这些eQTL与IMD遗传间的显著关联。”

“到已确定,在这一领域,大规模的遗传物质和系统遗传物质科学研究主要是依靠拉丁美洲**透过的,尽管群体重要性对于粗略理解遗传物质系统至关最主要。”科学研究医护人员说道,“这个南韩受测者的eQTL图说道对于抛开这种以拉丁美洲为中会心的偏见,结合拉丁美洲的采样集更进一步科学研究DNA表征的系统,也不具最主要内涵。”

科学研究医护人员渴望ImmuNexUT采样库将继续下降,并最后为症状带来更为好的结果。他们说道:“与之前报道的天然资源相比,我们的采样集不具奇特而利于的特点,都有正因如此面的免疫细胞肝细胞细分、**间免疫细胞状况的巨大变化以及同质的非拉丁美洲**。”

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